Ученые выявили соединения, которые ингибируют белки, участвующие в хронических воспалительных заболеваниях
Молекулы, известные как T23 и T8, ингибируют функцию белка, называемого фактором некроза опухолей (ФНО), который участвует в воспалении при таких заболеваниях, как ревматоидный артрит, болезнь Крона, псориаз, рассеянный склероз и др. Препараты, которые ингибируют функцию ФНО, считаются наиболее эффективным способом борьбы с такими заболеваниями. Однако не у всех пациентов отмечается положительный ответ на данную терапию, и ее эффективность может снижаться с течением времени.
Чтобы помочь в обнаружении лучших препаратов ингибиторов ФНО исследователи разработали новую компьютерную платформу для скрининга лекарств. Платформа использовалась для виртуального скрининга почти 15 000 молекул с неизвестной активностью и для прогнозирования их взаимодействия с белками ФНО. Этот виртуальный эксперимент выявил девять перспективных молекул из тысяч кандидатов.
Для дальнейшей оценки вероятного потенциала ученые изучили девять малых молекул в реальных лабораторных экспериментах. Из девяти молекул T23 и T8 оказались наиболее эффективными ингибиторами ФНО, и также продемонстрировали низкий уровень токсических побочных эффектов у людей.
В дальнейших исследованиях T23 и T8 могут быть дополнительно оптимизированы для разработки улучшенных методов лечения целого ряда воспалительных и аутоиммунных заболеваний.
Между тем новый подход к скринингу с использованием виртуального препарата мог бы помочь в обнаружении других перспективных ингибиторов ФНО и может быть модифицирован для поиска потенциальных методов лечения других заболеваний.
Источник: Georgia Melagraki, Evangelos Ntougkos, Vagelis Rinotas, Christos Papaneophytou, Georgios Leonis, Thomas Mavromoustakos, George Kontopidis, Eleni Douni, Antreas Afantitis, George Kollias. Cheminformatics-aided discovery of small-molecule Protein-Protein Interaction (PPI) dual inhibitors of Tumor Necrosis Factor (TNF) and Receptor Activator of NF-κB Ligand (RANKL). PLOS Computational Biology, 2017; 13 (4): e1005372 DOI: 10.1371/journal.pcbi.1005372